Tonkabohnen werden für Desserts, Süßspeisen, Kuchen, Kekse und Schokolade verwendet. Oft wird Sie auch als Kaffeegewürz genutzt. Die Bohnen werden mit einer feinen Reibe (z.B. Nagelpfeile) gerieben oder in Milch für die Süßspeise ausgekocht und können anschließend wieder verwendet werden.
Tonkabohnen schmecken süß und vanilleähnlich. Tonkabohnen enthalten Cumarin, welches durch Fermentation entsteht. Durch Cumarin bilden sich die feinen weißen Kristalle auf der Oberfläche der Bohne. Wie auch bei Vanille entsteht durch diesen Prozess das spezielle Aroma.